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posttranslational
posttranslational modification [ʎautsɔ̃hrift] СУЩ.
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posttranslational modification
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PtdIns ( 4,5 ) P2 is formed by PI4P 5-kinases, which are represented in Arabidopsis as a family of eleven isoenzymes.
PI4P 5-kinases from various eukyryotic models are regulated by posttranslational modification, and it has been demonstrated that several Arabidopsis PI4P 5-kinases can be phosphorylated.
So far, it has remained unclear under what circumstances phosphorylation occurs, which amino acid residues are phosphorylated, and what consequences of phosphorylation are with regard to localization or functionality of the enzymes.
www.biochemtech.uni-halle.dePtdIns ( 4,5 ) P2 wird durch PI4P 5-Kinasen gebildet, die in Arabidopsis als Enzymfamilie aus 11 Isoenzymen vorliegen.
PI4P 5-Kinasen verschiedener eukaryotischer Modellsysteme werden durch posttranslationale Modifikation reguliert und es wurde gezeigt, dass verschiedene PI4P 5-Kinasen aus Arabidopsis phosphoryliert werden können.
Bislang blieb jedoch ungeklärt, unter welchen Umständen Phosphorylierung vorliegt, welche Aminosäuren phosphoryliert werden, und was Konsequenzen hinsichtlich Lokalisierung und Funktionalität der Enzyme sind.
www.biochemtech.uni-halle.deAfter appropriate sample preparations, which can also include a directed cleavage of the protein by proteases and the chromatographic separation of the resulting products, it is possible to verify the correct amino acid sequence with high sequence coverage ( LC-MALDI-MS / MS ).
In this analysis, contingently present posttranslational modifications can also be investigated.
Application example:
www.igb.fraunhofer.deNach entsprechenden Probenvorbereitungen, die auch eine gezielte Spaltung des Proteins durch Proteasen und die chromatographische Auftrennung der dabei entstehenden Produkte beinhalten kann, ist es möglich, die korrekte Aminosäureabfolge mit hoher Sequenzabdeckung zu prüfen ( LC-MALDI-MS / MS ).
Bei dieser Untersuchung können auch eventuell vorhandene posttranslationale Modifikationen untersucht werden.
Beispiel:
www.igb.fraunhofer.deIn addition to this, phosphorylation, which plays an essential role in the regulation and signal transduction of many cellular processes and can be relevant to a disease, can be analyzed and quantified globally.
Other posttranslational modifications, such as for example acetylation or glycosylation can be detected with mass spectrometrical methods as well.
Contact:
www.pure.rub.deZudem können Phosphorylierungen, die in vielen zellulären Prozessen eine essentielle Rolle in der Regulation und Signaltransduktion spielen und krankheitsrelevant sein können, auf globaler Ebene analysiert und quantifiziert werden.
Auch andere posttranslationale Modifikationen, wie beispielsweise Acetylierungen oder Glycosylierungen, lassen sich mit massenspektrometrischen Methoden nachweisen.
Ansprechpartner:
www.pure.rub.deMaldi Träger
Beyond this, the use of mass spectrometry allows collection of information on the exact mass, the amino acid sequence and possibly existing (posttranslational) modifications.
By means of the mass spectrometric analysis of the ISD fragments of a protein, it is possible to read the amino acid sequence from both the N and the C terminus.
www.igb.fraunhofer.deMaldi Träger
Der Einsatz der Massenspektrometrie erlaubt es darüber hinaus, Informationen über die exakte Masse, die Aminosäuresequenz und möglicherweise vorhandene (posttranslationale) Modifikationen zu gewinnen.
Durch die massenspektrometrische Analyse der ISD-Fragmente eines Proteins lässt sich die Aminosäuresequenz sowohl vom N- wie auch vom C-Terminus her auslesen.
www.igb.fraunhofer.deUsing MS / MS analysis, we were able to trace this back to a reduced degradation of the collagen due to the improved purification procedure.
Moreover, posttranslational modifications were identified, which provided new insights into the structure of collagen in vivo.
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www.igb.fraunhofer.deDies konnten wir anhand der MS / MS-Analyse auf einen geringeren Abbau des Kollagens durch die Aufreinigungsprozedur zurückführen.
Weiterhin wurden posttranslationale Modifikationen identifiziert, die neue Erkenntnisse über die Struktur des Kollagens in vivo lieferten.
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www.igb.fraunhofer.deIn combination with graphic evaluation software this allows the comparison of different, complex samples.
This technology is also capable of depicting different posttranslational modifications.
Mass spectrometry is then subsequently used to identify a protein which can be used as biomarker from the gel.
www.igb.fraunhofer.deBei Proteinen kann die zweidimensionale Gelelektrophorese zum Einsatz kommen, die in Verbindung mit einer graphischen Auswertungssoftware den Vergleich unterschiedlicher, komplexer Proben erlaubt.
Diese Technologie ist ebenfalls in der Lage, unterschiedliche posttranslationale Modifikationen darzustellen.
Die Massenspektrometrie wird dann im Anschluss eingesetzt, um ein als Biomarker verwendbares Protein aus dem Gel heraus zu identifizieren.
www.igb.fraunhofer.deDepending on the species, the proteome can comprise up to 1,000,000 protein species and thus normally exceeds the number of gene sequences encoded in the genome many times over.
This is primarily the result of mRNA splicing and subsequent (posttranslational) modifications of the proteins.
Posttranslational protein modifications occur subsequent to translation.
www.igb.fraunhofer.deJe nach Art kann das Proteom bis 1 000 000 Proteinspezies umfassen und übersteigt damit die Zahl der im Genom kodierten Gensequenzen üblicherweise um ein Vielfaches.
Dies wird hauptsächlich durch mRNA-Splicing und nachträgliche (posttranslationale) Modifikationen des Primärproteins verursacht.
Massenspektrometrie für die Proteinanalytik
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