The aminoterminal part of VP4 contacts several other protomers around the axis.
Also, in the pentamer there are additional structural elements pertaining to it s stability.
www.biologie.uni-hamburg.deDer aminoterminale Teil von VP4 berührt mehrere andere Protomere an der Achse.
In dem Pentamer gibt es weitere Strukturelemente, die zur Stabilisierung beitragen.
www.biologie.uni-hamburg.deThe loops contain charged amino acids generating electrostatic forces as well as hydrophobic residues to glue the protomers together by van der Waals forces.
In a cutaway view of the pentamer there is a deep groove to be seen beneath the VP1-turret which you find in the literature termed canyon.
A view down a threefold axis shows alternately VP2 and VP3 on the outer surface.
www.biologie.uni-hamburg.deDie geladenen Aminosäuren dieser Schlaufen generieren elektrostatische Kräfte, während hydrophobe Aminosäuren die Protomere durch van der Waals-Kräfte binden.
Im Schnittbild des Pentamers sind um den VP1-Turm tiefe Furchen zu sehen, die in der Literatur Canyon genannt werden.
Ein Blick auf eine dreizählige Achse zeigt auf der äußeren Oberfläche alternierend VP2 und VP3.
www.biologie.uni-hamburg.deProtein chain A2 forms a continous helix which is bent at one point by 52 °.
This rigid chain fastenes the catalytic subunit to the B pentamer; the bent part of the helix is in a central pore between the B subunits and is held in place by the surrounding helices.
The last four amino acids ( Lys Asp Glu Leu ) at the carboxyl terminus of A2 correspond to the recognition sequence for the retention of proteins in the endoplasmatic reticulum ( KDEL-motiv ).
www.biologie.uni-hamburg.deDie Proteinkette A2 bildet eine durchgehende Helix, die lediglich an einer Stelle um 52 ° geknickt ist.
Diese in sich starre Kette verankert die katalytische Untereinheit in dem B-Pentamer, der abgeknickte Teil der Helix liegt in der zentralen Pore zwischen den B-Untereinheiten und wird dort durch die umgebenden Helices fixiert.
Die letzten vier Aminosäuren ( Lys Asp Glu Leu ) am Carboxylende von A2 entsprechen der Erkennungssequenz zur Retention von Proteinen im Endoplasmatischen Retikulum ( KDEL-Motiv ).
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